パートリーダーになっているのならそれなりの実力等はあると思います。なので、その部長の人ともそこまで実力の差は無いと思います。部長さんがしっかりしているならどのように練習するか、ここはどうするか、など話し合ってみたり、やっている間に気付いたことなどはその場で言いましょう。とにかくその人に負けない行動力と考えが必要です。
それに部長さんは自分の仕事があることもあるので常に自分が引っ張るんだ！、と思いましょう。パートリーダーが事前に計画を立てておかないと練習が進まなくて時間が過ぎるだけになる可能性があります。
基本的には最初にロングトーンなどの基礎練をやって音を合わせてから楽譜を細かく区切って練習していくと良いと思います。また、合奏中に注意されたことはしっかり覚えておき、パート練習のときに確認しながらやっていきましょう。
僕の場合はトランペットで、部長兼パートリーダーでしたが両方をどうじにこなすのはなかなか難しかったのでやはりパートリーダーの人を中心にやっていくほうがいいと思いますのでがんばって下さい